Ir al contenido principal

Instalación de RMarkdown

En una serie muy popular de televisión de mediados de los años 2000 (Glee), Sarah Jessica Parker actúa en algunos capítulos y dice que tenemos que reinventarnos varias veces en la vida para alcanzar el éxito o quizás no lo logremos pero se tienen que hacer intentos sin lugar a dudas. Felizmente pero con muchos retos a cuestas, ahora estamos aprendiendo aun más del lenguaje de programación R, ya que es una de las apuestas de mi nueva dirección. Tengo algunos artículos pasados donde detallo lo de R desde el mundo de las encuestas (paquete survey) donde empezamos a gatear referente a este lenguaje de programación.
 Ahora mi director hace una apuesta para que R aparte de sacar cifras, documente los procesos y los productos adyacentes creando archivos tales como páginas web, archivos de adobe e inclusive documentos de MSWord. Para ello existe el paquete RMarkdown. 


"El paquete RMarkdown (J. Allaire, Xie, McPherson, et al. 2020) fue desarrollado a inicios del 2014. En los últimos cuatro años, ha estado continuamente evolucionando hasta convertirse en un ecosistema completo para la creación de documentos, es por ello que es una buena oportunidad para escribir esta guía definitiva de dicho ecosistema. En este punto, existen un gran número de tareas se pudieran hacerse con RMarkdown: 
  • Compilar un documento RMarkdown para crear un reporte en diferentes formatos, tales como PDF, HTML, o Word. 
  •  Crear cuadernos en los cuales puedes ejecutar trozos (chunks) de código de forma interactiva.
  •  Crear diapositivas para presentaciones (HTML5, LaTeX Beamer, o PowerPoint). 
  •  Producir tableros de control con diseños flexibles, interactivos y atractivos.
  •  Desarrollar aplicaciones interactivas basadas en Shiny. 
  •  Escribir artículos periodísticos. 
  •  Escribir libros con varios capítulos. Generar sitios webs y blogs." (Xie et al, 2020)
Sin duda he encontrado un buen equipo de trabajo que están siempre dispuestos a apoyar sin embargo buscando desarrollar y documentar la primera experiencia que es instalar el paquete, decidí hacerlo de forma independiente (aunque mi compañero Edgar me dio muy buen tip o algo que no había considerado) y después de muchos intentos pude instalar el paquete RMarkdown. Es por ello que les comparto un video donde documento parte de mis peripecias:


En este video menciono que cuando creí que ya tenía el "script" para ahora si instalar el RMarkdown sin problemas, me mandaba un error a la hora de querer ejecutar el tinytex::install_tinytex() en una Lanix de escritorio con procesador AMD FX, y volvió la frustración a apoderarse de mi. Sin embargo había ya instalado MikTex en ese equipo. El error que me mandaba es el siguiente:

"tlmgr conf auxtrees add "C:/PROGRA~1/R/R-40~1.2/share/texmf"
Error in system("tlmgr", args, ...) : '"tlmgr"' not found

No tengo la certeza si funciona en todas las circunstancias, pero en esta ocasión fui a la carpeta donde había instalado MikTex y la borré de manera física, por omisión se instala en el siguiente directorio:

C:\Users\myusername\AppData\Local\Programs\MikTex

Una vez borrado el directorio procedió todo de forma correcta y pude instalar el RMarkdown.

Otra cosa muy cierta es que si hay problemas con la conectividad del internet, puede ser que los paquetes se descarguen incompletos y esto provoca muchos problemas.

Hasta aquí este post referente a RMarkdown instalación y seguiremos publicando nuevos avances en este tema.

Miguel Araujo.







Comentarios

Entradas populares de este blog

Posit Cloud - como instalar librerías de Python en el entorno de R

 Ahora que estamos tomando una maestría buscando que siga "girando la ardilla" por unos años más en la materia de "Cómputo Estadístico" nos ha sugerido usar la versión gratuita de Posit en la nube. En su página definen este producto como "es una solución basada en la nube que permite acceder al poderoso conjunto de herramientas de ciencia de datos de Posit directamente en el navegador web  - sin requerir instalación o configuraciones complejas". Para los usuarios que han utilizado Posit RStudio en primera instancia verán el entorno muy similar a Posit Cloud con algunas pequeñas diferencias, para empezar necesitamos un usuario o contraseña aunque es posible autenticarse usando alguna cuenta existente como es el caso de Google. Con el tiempo y trabajando en desarrollo de software, vamos entendiendo que quizás el nombre queda muy grande a los pequeños ejemplos, pero es muy recomendable el uso de proyectos siempre. A continuación vemos el entorno Posit Clo...

La librería openxlsx

En el Instituto se utiliza como herramienta de trabajo institucional la suite de ofimática MS Office que ofrece un precio asequible aunque lo actual en el mundo del software es el esquema de suscripciones el que casi se ha convertido en el común de las empresas gigantes de las tecnologías de la información. Es por ello que si bien en un principio que se usaban las bibliotecas XLConnectJars   y XLConnect, al tratar de bajarlas e instalarlas se descubrió - en aquel entonces - que estaban obsoletas. Es por ello que se volteo a la que revisaremos superficialmente en este artículo. Lo primero como siempre es descargar la librería openxlsx que se puede hacer desde el mismo Posit RStudio. Vamos a recrear un cuadro existente en el sitio del Instituto que debido a la crisis sanitaria iniciada en 2020 cobra una relevancia muy importante: "Las principales causas de muerte" que de forma anecdótica   fue la primera aplicación en la cual me pidieron que participara, un programa escri...

R 4.5 vs R 4.4.3

Cuando comparto con mis colegas, sobre todo de trabajo que es mi nicho profesional, acerca de porque tener las últimas versiones del software y que replico sobre todo por dos vertientes: mejor desempeño y funcionalidad del software, y la seguridad que pareciera que las empresas de software recomiendan los mismo o algo cercano a esto. Por ejemplo, veamos lo que nos dice Oracle (dueño de Java) acerca de su versión 8 del Java SE.   En la tabla de la página de Oracle podemos observar las fechas en los cuales ya no habrá soporte para ciertas versiones de Java. En este breve artículo veremos en el caso del interprete de R como se desempeña en una versión con respecto a la más reciente. Los puestos de trabajo que se registran por los patrones en el IMSS ha sido una cifra que muestra el avance o retroceso de como se encuentra el empleo en nuestro país, en este caso diremos que en el sector formal. Los microdatos oscilan arriba de los 20 millones y para su procesamiento es necesario o divi...